1398年

闰五月　八日，帝病危。十日，卒于西宫，时年七十一岁。遗诏，太孙允炆宜登大位。十六日，朱允炆即皇帝位。以明年为建文元年。同日与皇后同葬钟山之阳，名孝陵。上谥号为“太祖钦明启运俊德成功统天大孝高皇帝，孝慈昭宪至仁文德承天顺圣高皇后。（后有改动）尊母妃吕氏为皇太后。

六月　以受顾命之兵部左侍郎齐泰为兵部尚书，太常寺卿，曾伴读东宫之黄子澄兼翰林院学士，同参军国大事。

七月　齐泰与黄子澄建议削藩。周王朱以谋反罪名被逮捕。征汉中府教授方孝孺至，擢为翰林院侍讲。日侍帝左右备顾问。临朝奏事，臣僚面议之事，命方就殿中批答之。

八月　废周王朱为庶人。又命逮齐王朱榑、代王朱桂、岷王朱楩，燕王朱棣则疑惧。

十月　当初随从燕王来北平的僧道衍密劝燕王起兵。燕王称病，但暗自练兵。

十一月　帝派工部侍郎张昺为北平布政使??密旨，监视燕王。

十二月　燕府长史葛诚，奉燕王命奏事京师。帝召见，问府中事，葛诚以实相报。帝遣还，令其在逮燕王时作内应。王有所察觉。