丘巨源，（?-?）
南朝齐兰陵人。
少举丹阳郡孝廉。
宋孝武帝大明五年，助徐爱撰宋之国史。
宋明帝即位，使参诏诰，引在左右。
历佐诸王府，官至羽林监。
入齐，拜武昌太守，不乐。
曰：“古人云：‘宁饮建业水，不食武昌鱼。
”乃为馀杭令。
萧鸾(齐明帝)为吴兴太守，巨源作《秋胡诗》，有讥刺语，以事见杀。
以才学知名。
原有集，已佚。